７２１系の区分

区分	編成番号	解説
１次車	F1〜F8	1988年製造分。札幌—琴似間の高架化に合わせて製造された。721系を製造した車輌メーカー３社全てが製造している。この区分だけ座席の色が赤で、デッキの壁も青に白抜きのすずらん模様とかなり派手な装い。口が悪い人は「まるでディスコのようだ」と言っていた。車外の車輌番号が黒文字なのはこの区分だけ。
２次車	F9〜F16(3016)	1989年製造分。基本的には１次車と変わりないが、内装色の評判が悪かったのか、座席の色が茶色をベースとした物になり、デッキの壁も水色にすずらん模様と言った落ち着いた物になった。細かい所では客室前後の壁に付いている暖房器がカバー付きの物からカバーなし、角丸の物になっている。また、車外についている車輌番号が黄緑に白の縁取りの物になった。
３次車	F17(3017)〜F18(3018)	1990年製造分。２次車との変化はない。この区分の特筆すべき事としては、F-17編成がＪＲ北海道の苗穂工場でノックダウン生産されたと言う事だろうか。年度の製造数も２本と全体を通じて一番少ない。
４次車	F19(3019)〜F22(3022)	1991年製造分。非VVVF車の３両編成の最終生産分。この区分からクモハの屋上についている放熱器カバーの形が台形の物から、クーラーキセと同じ断面の物に変わっていて、初めて外観に変化がついた。また、この区分から車輌番号が白文字になった。客室端の暖房器が角丸から、角の折り目がはっきりついたものに変わっている。F-22編成は92年に増備されたF-23の3両を組み込んで6両固定編成化された。
５次車	F23(3023) F101・201(3101・3201)〜F103・203(3103・3203)	1992年製造分。新千歳空港ビルへの乗り入れを控えて、初めて登場した６両固定編成で、そのため、サハ721型とモハ720型が新形式として登場している。 F-23は４次車のF-22編成に増結して６両固定編成を作るために製造されたため、モハ720、モハ721、サハ721型だけが存在する。細かい所で車内の室温計がアナログからデジタル式に変わっている。そのため、F22-23編成には車輌によって両方の室温計が付いている。(ただし、4次車以前の編成でもデジタル式に交換されているのもあるが、形が違うのですぐにわかる。)
６次車	F1001〜F1005	1993年製造分。それまでのサイリスタ連続位相制御から特急用の785系のシステムを基本としたVVVF制御に変わり、初めてシステム的に大きな変化がついた。モーター出力も大きくなり、中間車のみがM車となり、両端がクハとなったため、札幌方が2000番台と区別されている。2000番台にはそれまであった雪切室がなくなったため初めて車椅子スペースが設けられいてるが、なぜか0,100番台の雪切室の反対側となっている。また、その部分に隣接した座席は苫小牧方向に固定されていて転換不可能になっている。また、細かい所では窓の厚さが従来より1mm薄い4mmの熱線吸収ガラスになり、椅子も軽量化されている。。F-1005のみ他の編成と少し制御システムが違っていたと言う記憶があるのだが、資料が無く定かではない。2003年9月〜11月の8次車の増備に伴って8次車と編成替えが行われ、F-4101〜F4104・F-5001・F-5101〜F-5103に組み込まれている。
７次車	F1006〜F1009	1994年製造分で。基本的には６次車と同じで変化はない。F-1009は９５年に次の731系のシステムの試験のため、VVVF素子がGTOからIGBTに変更されたのを始めとして、７３１系とほぼ同じシステムに変更されていて、M車屋上の機器が撤去されている。2003年9月〜11月の8次車の増備に伴ってF-1009を除き8次車と編成替えが行われ、F-4101〜F4104・F-5001・F-5101〜F-5103に組み込まれている。現存する1000番台はF-1009のみである。
8次車	F-4101〜F4104 F-5001 F-5101〜F-5103	実に9年ぶり、2003年製造分。全て中間車のみで、旧F-1001〜1008編成と併せて組み替え6両貫通編成となっている。(F-5001のみは3両編成)9年ぶりの新造車と言うこともあって、従来の721系とはかなり変化している。外観ではまず窓配置が変わり、Uシート車以外では戸袋窓が無くなり、721系では初めて転落防止用の外幌も設けられた。またモハではパンタがシングルアームとなり、サハも含めて床下はボディマウントが施され着雪防止対策としている。他にクーラーの容量増大に伴いクーラーキセも従来の物よりも大きい。車内に目を移すと、5001とuシート車を除いて一番大きな変化がデッキの仕切が廃止され従来一人がけ座席の部分がロングシート化されている。また、シート地の色も従来無かった青系統の物が採用されていて、手すりも大きくなっている。乗降ドアの上部3箇所には情報パネルが設けられ、天井の作りが731系に類似した感じになっている。uシート車の車内は従来車のイメージを一番残しているが、色使いはかなり変わった感じになっている。また、uシートの座席は789系やキハ261系の普通車と基本的に同じ物が使われている。モーター出力が230psに大きくなったため同一編成内に従来からのモハと新造のモハが混在しないように編成が組まれ、従来モハの編成が4000番台、新造モハの編成が5000番台となっている。